病理組織を分子解析に活用する
病院や研究機関では、組織の形態を観察するために、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）標本が広く使用されています。
FFPE標本は組織構造を保存しやすく、病理学的な評価に適しています。一方、組織全体からDNAやRNAを抽出すると、さまざまな細胞集団の情報が混在するという課題があります。
例えば、がん組織には、がん細胞だけでなく、免疫細胞、線維芽細胞、血管内皮細胞などが存在します。
特定の細胞集団の分子情報を詳しく調べたい場合には、目的とする領域を選択的に回収することが重要になります。
LCMによる目的領域の選択的回収
レーザーマイクロダイセクション（LCM）は、顕微鏡で観察した組織から、目的とする細胞や微小領域をレーザーによって分離・回収する技術です。
H&E染色などで組織構造を確認しながら、解析対象となる領域を選択できます。
例えば、腫瘍組織の中からがん細胞が多く存在する領域を回収し、周囲の間質組織とは分けてDNAやRNAを解析することが考えられます。
これにより、組織全体の解析では捉えにくい、目的領域に由来する分子情報を調べることができます。
FFPE組織を用いる際の注意点
FFPE組織は、固定や保存の過程で核酸が断片化したり、化学的な修飾を受けたりする場合があります。
そのため、LCMで目的細胞を回収できたとしても、必ずしも十分な品質のRNAやDNAが得られるとは限りません。
実験では、以下の点を検討する必要があります。
・FFPE標本の固定条件と保存期間
・組織切片の厚さ
・染色方法
・回収する細胞数や組織面積
・DNA・RNA抽出方法
・下流解析に必要な試料量と品質
特にRNA-seqなどを行う場合には、回収後の核酸品質の確認が重要です。
Accuva CellectによるFFPE組織の回収
米国LAXCO社のAccuva Cellectは、赤外線（IR）レーザーによる細胞回収と紫外線（UV）レーザーによる組織切断を1台に搭載したLCMシステムです。
FFPE組織、凍結組織、H&E染色標本、蛍光染色標本など、幅広い試料に対応しています。
目的とする組織領域の形状や試料の状態に応じて、回収方法を選択できることが特徴です。
まとめ
FFPE組織を用いた分子解析では、目的細胞の選択的な回収が重要です。
LCMは、病理組織の形態情報を活用しながら、特定の細胞集団を分離するための有用な技術です。
Accuva Cellectの製品仕様やFFPE組織への応用については、株式会社インミディアムまでお問い合わせください。
製造元：LAXCO, Inc.（米国）
国内取扱い：株式会社インミディアム
https://www.inmediam.com